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这个故事纯属虚构，并非火影同人小说，但是借鉴了火影中的各种忍术、血继的设定，其中比如“写轮眼”、“白眼”等血继限界、尾兽、风火水土雷的查克拉属性也保留，但情节与火影的故事无关。在日本古代曾有一段时期是忍者的时代。在那个忍者时代，忍者成为了国家的主要战力，忍村与大名间唇齿相依。忍村需要大名的号召力和人口物资的支持，而大名需要忍者来保卫自己的国家。在一次次的战乱中，十余个大名们逐渐相互吞并，形成了以西部的“和之国”，和东面的“雷之国”与“水之国”呈三国鼎立之势，其中和之国占据了日本近达60%的领土，最为强大。
随着战乱结束，忍者的作用也越来越小。民众发现在生活中越来越不需要忍者的保护，反而是忍者占用了大量资源，不断发动规模不等的战争。忍者自有忍者的骄傲，忍者们都以身为忍者为荣，相应的，忍者普遍认为自己比平民优秀高贵，哪怕是最善良的忍者也不例外。这种身份上的不平等更引起了平民广泛的不满，逐渐到达了不可容忍的地步。
武士作为古老的一种国家主要战力，在忍者崛起后逐渐被淘汰，然而残余的武士为了振兴武士阶层，在经过长期的隐忍后，开发出适合自己的战斗手段。为了重登历史舞台，武士也不断打压忍者，证实自己的实力。
另一方面，大名对于忍者这样一个可怕而又不可控制的力量也深为忌惮。忍村的具体事务，大名只可以在名义上予以册封，没有直接的管理权。这是任何一个力图建立专制政权的君主所无法容忍的。所以大名全力扶持武士这一群体，并煽动民众对忍者的不满。终于忍者这一群体不容于整个社会。忍者村在经历过多次削减经费，压缩规模后，人数大为减少。在老一代忍者老去后，新一代的忍者不能撑起国家战力主体的重任。因此忍村这样的组织逐渐解散，大名重新掌控了国家的武装力量。
为了抹灭忍者在世上的印迹，大名们修改了史书，忍者们的功勋被抹杀，查克拉一词也被删除。武士所运用的人体力量本原也是查克拉，但被改称为斗气。僧侣们所运用的力量被称作为灵力。忍者成为妖魔的代名词，所使用的人体力量被称为妖力。忍术虽然仍然被允许运用，但其中血继限界者被称为妖魔在人间的后裔，一经发现立刻格杀。许多血继限界者或逃离了国度或隐藏身份。