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很久很久之后，固拉多从地底的岩浆中诞生，盖欧卡在深海的海沟中出现，烈空坐则形成于臭氧层的物质中。烈空坐在臭氧层中盘旋，偶尔也会来到天空之柱休憩。固拉多和盖欧卡分别扩张着大陆与海洋。两只超上古神兽终于碰面，带来了为争夺在神奇宝贝世界之初的优势而进行的激烈战斗。烈空坐最终平息了这场战斗，并使得固拉多与盖欧卡回到各自长眠的洞窟中。为了防止两只超古代神奇宝贝再度醒来，红色宝珠与蓝色宝珠被制造，并保管于送神火山。当时，梦幻在世界各地出现，有相当多的分布数量。除此之外，神奇宝贝世界中出现了天冠山一类的地块，随着雷吉奇卡斯在陆地间的移动，形成了各个地区，在天冠山周围形成的是神奥地方。在这场造山运动中，神奥地方的东北部出现了严酷山，在其中的岩浆中诞生出席多蓝恩。阿尔宙斯创造了金刚玉魂、白玉魂和白金玉魂，之后进入了长眠之中。在石器时代、冰河时代和铁器时代，分别出现了雷吉洛克、雷吉艾斯和雷吉斯奇鲁，它们藏于丰缘地方，并作为打开在切锋神殿雷吉奇卡斯封印的钥匙。在今天形成了化石并包含着神奇宝贝的遗传基因。这一时期可能梦幻的数量开始减少，世界上更多地存在其它种类的神奇宝贝。除了神奇宝贝之外，神奇宝贝世界上还出现了人类。一只巨大的银色神奇宝贝栖息于钟之塔顶，相对的铃铃塔则住着彩虹色的凤王，通过这些资料也说明，神奇宝贝诞生比人类还早很多，这好比地球的动物历史一样，人类的起源神奇宝贝可以说功不可没，虽然是无意的除了创世神属于一级神兽，二级神兽掌管掌管时间（迪亚路加)，掌管空间（帕陆奇亚） 掌管反转世界（ 骑纳迪那），由克希：知识的先知，艾姆利多：情感的先知，亚克诺姆：意志力的先知
与创世神无直接关系
三级神兽，洛奇亚 ，凤王 ，雷吉奇卡斯，盖偶卡，古拉顿，裂空座
四级神兽（ 急冻鸟 闪电鸟 火焰鸟）（雷公 炎帝 水君） （雷吉洛克 雷吉艾斯 雷吉斯奇鲁）
除此这些之外，再就是幻兽，能力可能比一部分神兽强，但是地位没有神兽高，但是幻兽神兽都统称为‘神兽’
当然这些知识，现在说了也无益，等以后自己在慢慢探索把，说这些虽然没有跑题，但是也太早了
“妖妖，想什么呢？”爷爷打断我的沉思
“啊，没有”我连忙挂上笑容
“这边”佐竹在一个画着红叉叉的大门前停住，见我们没有跟过来，就忍不住叫到
门打开，里面是一片美不胜收“这里是两百万年前的世界”
一进去，假的化石翼龙就出没了，佐竹也开始介绍这里，这里就是还没有对外开放的古代神奇宝贝公园了
“华丽登场吧，我可爱的妖精！”我看着这里，化石翼龙一定会很喜欢，等闲下来，就问问它要不要把玻璃珠里的一个地方改成这样的